本作は、「大日本帝国」か「米国」どちらかの立場となり、シナリオを進めていきます。

シナリオを開始すると、インターミッションという出撃前の準備画面に移行します。ここで各種準備を整えた後、戦場マップへ出撃することになります。

この戦場マップをプレイしていくことで、100枚以上にも及ぶマップで構成された大東亜興亡史のシナリオは進行します。